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北京新发地凑集性疫情病毒来自何方?最新论断来了

  北京新发地市场凑集性疫情的病毒源自何方?最新论断来了!

  10月23日,清华大学、北京市疾病防备把持中间、中国医学迷信院病原生物学研讨所、北京大学、中国迷信院北京基因组研讨所结合在《国度迷信批评》发文,经过剖析相干病例、情况与食物等样品的核酸测序和病毒基因组序列,分离片面的盛行病学查询拜访和大数据剖析,研讨职员提醒,该疫情中病毒泉源极有能够是境外疫情多发区的冷链出口食物,并提出,冷链运输或为新冠病毒传达新道路。

论文电子版截图  论文电子版截图  

  2020年6月11日,1例新冠病毒传染患者突现,冲破了北京延续56天无新增病例的宁静。该患者顿时就被收治,病情也很快失掉把持,可是他从那边传染了病毒,却成为了一个谜。

  分离唆使病例的盛行病学查询拜访和大数据剖析,经过对其所到地域和打仗职员的排查,本市继而发明,2份来自北京新发地市场的情况样本出现新冠病毒核酸阴性。随后,新发地市场538名员工承受病毒核酸筛查,又有45人呈阴性。新发地市场随即成为存眷的核心,北京市无关部分武断对该市场采纳封闭办法,以无力抑止疫情的伸张。

  6月中旬,北京进一步促进核酸筛查,共发明368人新冠病毒核酸阴性。这些传染者均与新发地市场有间接或许直接联系关系:此中169人是新发地市场的任务职员,103人于5月30日至6月12日时期去过新发地市场,其他96人均为上述职员的打仗者。未发明自力于该市场的晚期传达链或自力传达链,提醒新发地市场是这次疫情爆发的繁多泉源。

新发地综合交易大厅负一层(牛羊肉厅)感染工作人员分布。新发地综合买卖大厅负一层(牛羊肉厅)传染任务职员散布。

  分离新发地市场盛行病学查询拜访,研讨职员开端断定综合买卖大厅公开一层(牛羊肉大厅)水产区S14号摊位能够是传染的泉源:S14号摊位的7位任务职员均为新冠确诊病例,且病症呈现工夫绝对较早。依据盛行病学模子揣度的疫情开端工夫范畴内,共有5位主顾新冠抗体检测阴性,且这5位主顾都到访过S14号摊位。这5位主顾及其亲密打仗者在过来14天内都未到访过中高危害地区或打仗来自中高危害地区的职员,进一步提醒疫情是由新发地市场向别传播。

  新发地市场凑集性疫情中的病例和情况样本中取得病毒基因组序列剖析标明其病毒序列具备分明的渐变特点,和我国以前所发明的外乡及输出病例均不相反,提醒该次疫情应为繁多性的境外输出。

  研讨团队进一步应用自立开辟的低病毒载量样品处置办法,对110个病例和情况样本停止了高通量核酸测序,共取得了72条高品质的新冠病毒基因组序列。剖析发明,这些序列均具备8个特点性渐变位点,这些位点在我国此前的外乡和输出病例中从未发明过。与新冠病毒基因序列数据库比对,发明除C6026T渐变位点以外,具备别的7个渐变位点的病毒次要存在于欧洲。这些后果进一步提醒本次疫情的病毒应为繁多性的新发境外输出。

  新发地疫情中的病例和情况样本中取得病毒基因组序列剖析标明其病毒序列具备分明的渐变特点,和我国以前所发明的外乡及输出病例均不相反,提醒该次疫情应为繁多性的境外输出。

  综合上述后果,同时确认S14号摊位的任务职员未打仗过疑似或确诊新冠病毒传染者,且5月至6月早期北京也无陈述新增传染病例,提醒病毒很可能根源于境外输出。进一步伐查表现,S14号摊位售卖的物品中冰鲜三文鱼是独一来自境外的商品,且摊主曾于5月30日从某供给商处采买过从存在新冠病毒疫情国度出口、包装完好的三文鱼,在市场内切割处置后批发。为此,研讨职员对新发地市场内一切三文鱼供给商的冷库停止了采样检测,发明某供给商有5份鱼体拭子样本呈新冠病毒核酸阴性,此中1份未开封鱼体拭子样本中测序取得的病毒基因组序列与本次疫情中人和情况样本中的病毒高度同源。

  因未能从鱼体上别离取得活病毒,因而还没有法证实鱼体上的病毒生机。可是将高品质病毒基因组序列特点剖析与盛行病学查询拜访分离,提醒来自境外疫情多发区的冷链出口食物极有能够为本次新发地市场凑集性疫情病毒泉源。在文章宣布进程中,中国疾控中间陈述从青岛获得的冷链食物平分离出新冠病毒,进一步提醒冷链食物能够是新冠病毒传达的紧张道路。研讨关于提醒北京新发地市场凑集性疫情的病毒根源供给了紧张证据,为优化疫情常态化防控战略供给了紧张根据。

  研讨中,多家机构展开精诚协作。此中,北京市疾病防备把持中间新冠病毒肺炎防控和检测组到场实现现场查询拜访、样本收集和核酸筛查。中国医学迷信院病原生物学研讨所王健伟、任丽丽研讨团队在P3尝试室实现了样品的核酸测序前处置流程。清华大学王建斌课题组与北京大学黄岩谊课题组开展的疾速基因组测序样品处置办法为本次疫情关头样品的精确疾速病毒测序供给了技能根底和尝试撑持。中国迷信院北京基因组研讨所李明锟课题组实现了[@@]对关头样品序列的剖析。

  北京市疾病防备把持中间主任医师庞星火、主管医师吴双胜,中国医学迷信院病原生物学研讨所研讨员任丽丽和中国迷信院北京基因组研讨所研讨生马文泰为论文配合第一作者。

  图片来自清华大学构造生物学高精尖立异中间大众号

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